Outre ses activités syndicales, et son rôle auprès des sociétés savantes françaises et étrangères,
le Dr J.F. Rey est l'auteur de :
- 391 publications écrites
- 285 participations aux réunions scientifiques et workshops
- 46 films scientifiques

Ces publications ont été consacrées :
-    Traitement endoscopique des pathologies biliaires et pancréatiques
-    Développement technologique de l’endoscopie diagnostique
-    Exploration de l’intestin grêle par vidéo capsule endoscopique et entéroscopie à ballonnet